Amplificação cruzada e padronização de marcadores microssatélites em Colossoma macropomum (tambaqui)

Autores

  • Jacqueline Souza Lima Universidade Federal de Goiás
  • Mariana Pires de Campos Telles Universidade Federal de Goiás
  • Lucileide Vilela Resende Universidade Federal de Goiás
  • Felipe Oliveira Gouveia Universidade Federal de Goiás
  • Talge Aiex Boni Universidade Federal de Goiás
  • Ana Christina Sanches Universidade Católica de Goiás

DOI:

https://doi.org/10.5216/rbn.v5i2.9821

Palavras-chave:

Marcadores genéticos, peixe, transferibilidade

Resumo

A espécie Colossoma macropomum (tambaqui), muito cultivada em piscicultura por todo o Brasil, já apresenta perda de variabilidade genética em alguns estoques. O objetivo deste trabalho foitestar para esta espécie a amplificação cruzada de 52 locos microsatélites desenvolvidos originalmente para outras espécies da ictiofauna. Para tanto, foram coletados indivíduos de tambaqui de pisciculturada região de Goiânia, Brasil, e a extração do DNA para amplificação foi feita a partir de tecido muscular. Os testes de amplificação cruzada foram realizados alterando as temperaturas de cada loco, buscando a padronização da amplificação. Dos 52 locos testados, 16 apresentaram resultados satisfatórios de amplificação cruzada, o que permitiu a definição dos genótipos. Esses resultados indicam que existeum grande potencial de transferibilidade de marcadores microssatélites entre espécies diferentes da ictiofauna. Esses marcadores podem ser usados em estudos genético-populacionais desta espécie nosprogramas de conservação, manejo e melhoramento deste recurso pesqueiro.

Downloads

Não há dados estatísticos.

Biografia do Autor

Jacqueline Souza Lima, Universidade Federal de Goiás

Departamento de Biologia Geral, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de
Goiás, Campus Samambaia

Ana Christina Sanches, Universidade Católica de Goiás

Departamento de Zootecnia, Universidade Católica de Goiás, Campus II

Referências

Araújo, L. C. & M. Gouding. 1998. Os frutos do tambaqui: ecologia, conservação e cultivo na Amazônia. Sociedade Civil Mamirauá/CNPq, Brasília, DF, 186 p.

Barbosa, A. C. D. R., T. C. Corrêa, F. Galzerani, P. M. Galetti-Jr. & T. Hatakana. 2006. Thirteen polymorphic microsatellite loci in Neotropical fish Prochilodus argenteus (Characiformes, Prochilodontidae). Mol. Ecol. Notes 6: 936-938.

Brondani, C., P. H. N. Rangel, T. C. O. Borba & R. P. V. Brondani. 2003. Transferability of microsatellite and sequence tagged site markers in Oryza species. Hereditas 138: 187-192.

Calcagnotto, D., M. Russello & R. De-Salle. 2001. Isolation and characterization of microsatellite loci in Piaractus mesopotamicus and their applicability in other Serrasalminae fish. Mol. Ecol. Notes 1: 245-247.

Calcagnotto, D. & S. A. Toledo-Filho. 2000. Loss of genetic variability at the transferrin locus in five hatchery stocks of tambaqui (Colossoma macropomum). Genet. Mol. Biol. 23: 127-130.

Carreras-Carbonell, J., E. MacPherson & M. Pascual. 2007. Utility of pairwise mtDNA genetic distances for predicting cross species microsatellite amplification and polymorphism success in fishes. Conserv. Genet. 9: 181-190.

Carvalho-Costa, L. F., T. Hatakana & P. M. Galetti-Jr. 2006. Isolation and characterization of polymorphic microsatellite markers in the migratory freshwater fish Prochilodus costatus. Mol. Ecol. Notes 6: 818-819.

Creste, S., A. Tulmann Neto & A. Figueira. 2001. Detection of single sequence repeat polymorphisms in denaturing polyacrylamide sequencing gels by silver staining. Plant Mol. Biol. Rep. 19: 299-306.

Gao, L. Z., C. H. Zhang & J. Z. Jia. 2005. Crossspecies transferability of rice microsatelites in its wild relatives and the potential for conservation genetic studies. Genet. Resour. Crop Evol. 52: 931-940.

Grattapaglia, D., R. P. V. Brondani & C. Brondani. 2008. Manual prático para desenvolvimento de marcadores microssatélites em plantas. Embrapa, Brasília, DF.

Gupta, P. K. & R. K. Varshney. 2000. The development and use of microsatellite markers for genetic analysis and plant breeding with emphasis on bread wheat. Euphytica 113: 163-185.

Hatanaka, T., F. Henrique-Silva & P. M. Galetti-Jr. 2006. Population substructuring in a migratory freshwater fish Prochilodus argenteus (Characiformes, Prochilodontidae) from the São Francisco River. Genética 126: 153-159.

IBAMA. Instituto Brasileiro do Meio Ambiente e dos Recursos Naturais Renováveis. Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento, Secretaria Especial de Aqüicultura e Pesca. 2005. Produção brasileira de aqüicultura continental. Brasília, DF.

Katzir, N., Y. Danin-Poleg, G. Tzuri, Z. Karchi, U. Lavi & P. B. Cregan. 1996. Length polymorphism and homologies of microsatellites in several Cucurbitaceae species. Theor. Appl. Genet. 93: 1282-1290.

Liao, X., D. Wang, X. Yu, W. Li, L. Cheng, J. Wang & J. Tong. 2007. Characterization of novel microsatellite loci in rare minnow (Gobiocypris rarus) and amplification in closely related species in Gobioninae. Conserv. Genet. 8: 1003-1007.

Magalhães, A. L. B., R. F. Andrade, T. F. Ratton & M. F. G. Brito. 2002. Ocorrência da truta arco-íris Oncorhynchus mykiss (Walbaum, 1792) (Pisces: Salmonidae) no alto rio Aiuruóca e tributários, bacia do rio Grande, Minas Gerais, Brasil. Bol. Museu Biol. Mello Leitão 14: 35-42.

Matsuoka, Y., S. E. Mitchell & S. Kresovich, M. Goodman & J. Doebley. 2002. Microsatellites in Zea-variability, patterns of mutations, and use for evolutionary studies. Theor. Appl. Genet. 104: 436-450.

Morelli, K. A., E. Revaldaves, C. Oliveira & F. Foresti. 2007. Isolation and characterization of eight microsatellite loci in Leporinus macrocephalus (Characiformes: Anostomidae) and cross-species amplification. Mol. Ecol. Notes 7: 32-34.

Moretzohn, M. C. 2006. Desenvolvimento e mapeamento de marcadores microssatélites e identificação de QTLs ligados à produtividade e à resistência à mancha preta em Arachis sp. Tese de Doutorado. Universidade de Brasília, Brasília, DF.

Paterson, I. G., E. Crispo, M. T. Kinnison, A. P. Hendry & P. Bentzen. 2005. Characterization of tetranucleotide microsatellite markers in guppy (Poecilia reticulata). Mol. Ecol. Notes 5: 269-271.

Plieske, J. & D. Struss. 2001. Microsatellite markers for genome analysis in Brassica L. development in Brassica napus and abundance in Brassicaceae species. Theor. Appl. Genet. 102: 689-694.

Saha, C. M., J. D. Cooper, M. A. Rouf Mian, K. Chekhovskiy & G. D. May Theor. 2006. Tall fescue genomic SSR markers: development and transferability across multiple grass species. Appl. Genet. 113: 1449-1458.

Saracura, V. F. & N. Casagnolli. 1990. Comparação do desempenho entre os alevinos de pacu (Piaractus mesopotamicus) e híbridos de pacu e tambaqui (Colossoma macropomum). Ciênc. Zootéc. 5: 17-19.

Simon, J. C., S. Baumann, P. Sunnucks, P. D. N. Hebert, J. S. Pierre Gallic & C. A. Dedryver. 1999. Reproductive mode and population genetic structure of the cereal aphid Sitobion avenae studied using phenotypic and microsatellite markers. Mol. Ecol. 8: 531-545.

Strecker, U. 2003. Polymorphic microsatelites isolated from the cave fish Astyanax fasciatus. Mol. Ecol. Notes 3: 150-151.

Villacorta-Correa, M. A. & U. Saint-Paul. 1999. Structural indexes and sexual maturity of tambaqui Colossoma macropomum (Cuvier, 1818) (Characiformes: characidae) in central Amazon, Brazil. Rev. Bras. Biol. 59: 637-652.

Downloads

Publicado

07-05-2010

Como Citar

LIMA, J. S.; TELLES, M. P. de C.; RESENDE, L. V.; GOUVEIA, F. O.; BONI, T. A.; SANCHES, A. C. Amplificação cruzada e padronização de marcadores microssatélites em Colossoma macropomum (tambaqui). Revista de Biologia Neotropical / Journal of Neotropical Biology, Goiânia, v. 5, n. 2, p. 41–49, 2010. DOI: 10.5216/rbn.v5i2.9821. Disponível em: https://revistas.ufg.br/RBN/article/view/9821. Acesso em: 12 nov. 2024.

Edição

Seção

Artigos