APLICAÇÃO PRÁTICA DAS INTERAÇÕES INTERMOLECULARES ENTRE BIOMACROMOLÉCULAS E LIGANTES PELO LIGAND EXPLORER

Abstract

O Protein Data Bank (PDB)1 é o um banco de dados de estruturas tridimensionais de biomacromoléculas obtidas por métodos experimentais, tais como cristalografia de raios-X e ressonância magnética nuclear (RMN). Estas biomacromoléculas são alvos moleculares úteis para o processo racional de desenvolvimento de fármacos baseado na estrutura, pois se encontram complexados com o ligante, cujas interações intermoleculares entre ele e o alvo molecular podem ser estudas através do programa Ligand Explorer disponibilizado pelo PDB. O presente trabalho teve como objetivo mostrar como o Ligand Explorer pode ser aplicado em aula expositiva para explicar o processo de reconhecimento molecular entre o ligante e o receptor. Dessa forma, a estrutura cristalina da enzima conversora de angiotensina (ECA) complexada com captopril (código PDB: 2X8Z2) foi utilizada para exemplificar as interações de reconhecimento molecular