TRIAGEM VIRTUAL INVERSA COMO FERRAMENTA PARA A QUÍMICA DE PRODUTOS NATURAIS

Resumo

A Triagem Virtual Inversa, ou Triagem Inversa, consiste em uma busca em banco de dados de estruturas protéicas, sendo estas de relevância farmacológica, de maneira a evidenciar in silico, os receptores farmacológicos de atuação para um determinado ligante de interesse. A plataforma utilizada denomina-se sc-PDB, o qual é um software on-line que abriga somente alvos farmacológicos, sendo selecionadas a partir do PDB. O principal objetivo deste estudo é realizar o processo de TVI para neurotransmissores cujos receptores encontram-se descritos no PDB. Este estudo preliminar busca validar o método de TVI para uma posterior aplicação em compostos naturais. A estrutura dos neurotransmissores da adrenalina, serotonina e adenosina foram submetidos ao programa on-line sc-PDB. Onze variáveis foram estudadas, cada uma separadamente, mantendo as demais segundo o default do programa. Após esse procedimento foi estabelecido um protocolo, o qual será utilizado na busca de receptores de compostos naturais. Nesse protocolo ficou estabelecido o procedimento que encontra maior número de ligantes, na qual a molécula deve ser gerada sem os seus hidrogênios, sem estereoquímica, definindo como parâmetro de entrada subestrutura, e sem considerar variáveis como número de ligações rotáveis, de anéis ou de grupos doadores e receptores de ligação hidrogênio. 10.5216/ref.v8i1.10561